- Sejarah
- Peradaban prasejarah
- Roma kuno dan Yunani
- Abad Pertengahan dan Renaisans
- Abad XVIII
- Abad XIX
- Abad ke-20 dan ke-21
- Apa yang dipelajari mikologi? Bidang studi
- Ranting
- Taksonomi dan filogeni
- Biokimia, biologi sel dan fisiologi
- Bioteknologi dan mikologi industri
- Mikologi medis
- Mikologi pertanian
- Fitopatologi
- Ahli mikologi terkenal
- Contoh Penelitian Terbaru
- Referensi
The Mikologi adalah disiplin bertanggung jawab untuk studi jamur dalam berbagai aspek. Organisme ini sangat penting bagi manusia sejak zaman prasejarah. Awal mulanya berasal dari Yunani Kuno, ketika jamur diklasifikasikan sebagai tumbuhan. Kemudian, selama abad ke-18 dan ke-19, fondasi disiplin ini diletakkan.
Dermaga Italia Antonio Micheli (1679-1737) dianggap sebagai pendiri mikologi modern. Penulis ini membuktikan pentingnya struktur reproduksi dalam klasifikasi jamur.
Belakangan, Elias Fries dari Swedia (1794-1878) mengusulkan dasar nomenklatur jamur yang saat ini digunakan. Selanjutnya, mikologi telah dipelihara oleh disiplin ilmu seperti mikroskop, genetika molekuler dan genomik.
Mikologi memiliki beberapa cabang, di antaranya taksonomi dan filogeni menonjol, serta biokimia dan biologi sel. Bidang kedokteran, industri, mikologi pertanian dan fitopatologi juga dibahas.
Penelitian terbaru dalam sistematika mencakup penggunaan genomik untuk menghasilkan informasi tentang kekerabatan beberapa kelompok. Di bidang industri, studi difokuskan pada produksi biofuel dari aktivitas jamur.
Sejarah
Peradaban prasejarah
Sejak Paleolitik ada referensi arkeologi untuk penggunaan jamur. Dianggap bahwa beberapa jamur yang dapat dimakan dipanen untuk dikonsumsi untuk keperluan makanan. Demikian pula, lukisan telah ditemukan di mana jamur diwakili.
Di Afrika telah ditemukan bukti penggunaan jamur halusinogen oleh peradaban yang menghuni gurun Sahara. Juga di Eropa ada catatan penggunaan spesies Fomes fomento sebagai bagian dari sumbu yang digunakan untuk menyalakan api.
Ada catatan penggunaan jamur dalam budaya Maya di Meksiko dan Guatemala. Berbagai jamur dengan sifat halusinogen digunakan dalam ritual magis-religius budaya ini.
Roma kuno dan Yunani
Di kekaisaran Roma, jamur yang dapat dimakan sangat dihargai dan dianggap sebagai makanan kerajaan. Mereka juga digunakan sebagai racun untuk membunuh orang-orang penting. Beberapa deskripsi gejala kematian ini menunjukkan bahwa mereka disebabkan oleh spesies Amanita phalloides.
Namun, dasar-dasar mikologi mulai menetap dengan naturalis besar Yunani Kuno. Referensi pertama untuk budidayanya ditemukan dalam karya Athenaeus Yunani di Alexandria (abad ke-2 hingga ke-3 SM).
Orang pertama yang mendefinisikan jamur adalah filsuf Theophrastus (372-288 SM), yang menyatakan bahwa mereka adalah "tumbuhan tidak sempurna, tanpa akar, daun, bunga atau buah". Theophrastus menjelaskan empat jenis jamur yang masih dikelompokkan ke dalam famili yang berbeda hingga saat ini.
Kontribusi lain untuk mikologi dibuat oleh Dioscorides dalam karyanya "Della Materia Medica", di mana ia menjelaskan sifat toksik dari beberapa jamur. Demikian pula, dia adalah orang pertama yang mendeskripsikan jamur agaric (jenis jamur) yang banyak digunakan untuk tujuan pengobatan.
Claudius Galen (tabib Yunani) mengklasifikasikan jamur menjadi tiga kelompok berbeda: "bolités" (mungkin Amanita caesaera saat ini), "porcini", yang terletak di genus Boletus, dan "Mykés". Galen menunjukkan bahwa dua kelompok pertama dapat dimakan dan yang terakhir beracun dan sangat berbahaya.
Terakhir, Pliny the Elder dalam karyanya "Historis naturalis", merujuk pada fakta bahwa "boletus" mudah disalahartikan dengan jamur beracun lainnya. Penulis menilai bahwa jika jamur ini tumbuh di daerah yang mengandung zat beracun, mereka dapat menyerapnya.
Abad Pertengahan dan Renaisans
Selama Abad Pertengahan, mikologi tidak mengalami kemajuan besar, karena naturalis hanya mengikuti karya Dioscorides dan Pliny. Saat ini di Eropa terjadi masalah serius dalam budidaya gandum karena serangan ergot (Claviceps purpurea).
Belakangan, selama masa Renaisans, beberapa ilmuwan memberikan kontribusi yang sederhana untuk disiplin tersebut. Di antaranya, kami memiliki Andrea Mattioli, yang mendukung pendekatan palsu Plinio terhadap "porcini" yang beracun.
Ahli botani terkenal Andrea Caesalpinio mengusulkan klasifikasi jamur berdasarkan beberapa karakteristik morfologi dan berbagai kegunaan dari spesies yang berbeda.
Abad XVIII
John Ray, seorang ahli botani Inggris, memisahkan jamur menjadi tiga kelompok sesuai dengan kebiasaan pertumbuhan mereka (epigeal dan subterranean) dan karakteristik morfologi. Sementara itu, Joseph Tournefort (Prancis) membagi mereka menjadi tujuh kelompok menurut morfologi mereka.
Pier Antonio Micheli. Sumber: Tidak diketahui, tidak ditentukan. Wikimedia Commons
Pendiri mikologi modern dianggap sebagai Pier Italia Antonio Micheli. Dia adalah penulis beberapa penemuan yang dianggap mendasar dalam studi jamur.
Dia adalah orang pertama yang menunjukkan bahwa reproduksi terjadi melalui spora dan bukan melalui generasi spontan, seperti yang diyakini hingga saat ini.
Sistem klasifikasi jamur yang diusulkan oleh Micheli menetapkan empat kelas berdasarkan struktur reproduksi. Ini dianggap sebagai klasifikasi buatan, karena menggunakan karakter variabel dalam kelompok yang sama seperti warna.
Ketika Swiss Carolus Linnaeus mengusulkan nomenklatur binomial dalam karyanya “Systema Naturae” (1735), dia mengubah cara penamaan spesies. Linnaeus tidak memberikan kontribusi besar pada mikologi, tetapi sistemnya meletakkan dasar bagi peneliti lain.
Abad XIX
Selama abad ini, mikologi sepenuhnya diakui sebagai disiplin ilmu independen dari botani, terutama karena penerapan prinsip-prinsip yang ditetapkan oleh Micheli untuk mempelajari jamur.
Salah satu ahli mikologi paling terkenal saat ini adalah Christian Persoon. Karyanya didasarkan pada analisis struktur reproduksi, karya utamanya adalah "Synopsis Methodica Fungorum" (1801).
Penulis ini memisahkan jamur ke dalam kelas “angiocarpus” (spora yang matang di dalam tubuh buah) dan “gymnocarpus” (spora yang matang di luar tubuh buah). Dia menjelaskan lebih dari dua ribu spesies dalam dua kelompok besar ini.
Elias Fries (Swedia) dianggap salah satu ahli mikologi hebat dalam sejarah. Penulis ini menerbitkan lebih dari 26 karya ilmiah, yang dianggap sebagai dasar mikologi modern.
Karya utamanya adalah "Systema mycologicum" (1821), di mana ia mengusulkan klasifikasi berdasarkan konsep filogeni. Nama-nama yang diusulkan oleh penulis ini diterima sebagai dasar nomenklatur mikologi pada Kongres Botani Internasional di Brussel (1910).
Abad ke-20 dan ke-21
Mikologi membuat kemajuan besar ketika teknologi baru memungkinkan identifikasi jamur yang lebih akurat. Metode fisiologis dan biokimia, termasuk uji pertumbuhan dan pemanfaatan nutrisi, mulai digunakan pada awal abad ke-20.
Metabolit sekunder yang dihasilkan jamur juga mulai diidentifikasi dan dibuktikan kegunaannya dalam industri makanan dan farmasi.
Kemudian, pada tahun 90-an abad ke-20, perkembangan teknik molekuler terjadi, yang memungkinkan studi tentang hubungan filogenetik dalam jamur dan studi tentang komposisi genetiknya.
Akhirnya pada abad XXI sudah berkembang bidang genomik (studi tentang kandungan genetik). Teknik ini memungkinkan pengurutan seluruh genom dari berbagai spesies jamur.
Berdasarkan penelitian genom, identifikasi yang akurat dari berbagai kelompok yang tidak dapat dibedakan dengan teknik klasik telah tercapai. Demikian pula, kemungkinan penggunaan organisme ini di berbagai bidang, seperti produksi biofuel dan pengobatan, telah ditingkatkan.
Apa yang dipelajari mikologi? Bidang studi
Studi tentang jamur. Sumber: AJC1 dari Inggris, melalui Wikimedia Commons
Mikologi adalah disiplin ilmu yang bertanggung jawab untuk mempelajari jamur - Kerajaan Jamur - dan semua aspek yang terkait dengannya.
Dalam mikologi studi tentang karakteristik struktural, siklus hidup dan perilaku fisiologis jamur. Demikian juga, pengetahuan tentang proses evolusi dan pentingnya organisme ini dalam ekosistem dibahas.
Keragaman jamur. Sumber: Sasata, dari Wikimedia Commons
Karena pentingnya jamur untuk pertanian, mikologi telah mengembangkan bidang studi untuk kelompok simbiosis. Jamur pembentuk mikoriza (simbiosis antara jamur dan akar) mengoptimalkan penggunaan unsur hara oleh tanaman.
Aspek lain yang paling menarik adalah yang mengacu pada jamur patogen. Dalam pengertian ini, mikologi membahas studi tentang jamur parasit pada tumbuhan dan hewan.
Ranting
Mikologi membahas berbagai bidang studi. Hal ini mendorong para peneliti untuk mengkhususkan diri pada cabang-cabangnya yang berbeda, di antaranya adalah:
Taksonomi dan filogeni
Cabang ini berkaitan dengan identifikasi dan klasifikasi jamur, serta studi tentang hubungan antara jamur dan organisme lain. Berbagai sistem klasifikasi telah ditetapkan berdasarkan karakteristik morfologi, reproduksi, dan fisiologis, di antara aspek lainnya.
Dengan perkembangan teknik molekuler, filogeni telah dikembangkan untuk Kerajaan Fungi. Demikian juga, dimungkinkan untuk membangun hubungan dalam masing-masing kelompok besar jamur.
Studi tentang distribusi geografis dan ekologi dari spesies yang berbeda juga diperhitungkan. Penelitian tentang keanekaragaman dan status konservasi jamur di berbagai daerah sangat menarik.
Aspek penting lainnya dalam cabang ini adalah studi tentang hubungan ekologis jamur, yang membahas hubungan simbiosis dengan organisme lain, serta perilaku ekologis berbagai kelompok parasit.
Biokimia, biologi sel dan fisiologi
Cabang ini mempelajari komposisi kimiawi dan struktur sel jamur melalui teknik mikroskop, baik optik maupun elektronik, untuk mempelajari biologi sel.
Penelitian di bidang genetika memungkinkan pemahaman yang lebih baik tentang mekanisme reproduksi. Dimungkinkan juga untuk mencapai media kultur yang sesuai untuk pengembangan strain dalam kondisi yang berbeda.
Di bidang fisiologi, hubungan jamur dengan lingkungan dan bentuk gizinya dipelajari. Demikian juga, ini membahas pergerakan zat terlarut dan air, serta tropisme, taktik, dan mekanisme lainnya.
Bioteknologi dan mikologi industri
Fokusnya adalah penelitian tentang kegunaan jamur dalam berbagai aktivitas manusia, seperti penggunaan ragi dalam proses fermentasi atau mendapatkan obat-obatan.
Faktor fisiologis dari spesies yang berbeda ditangani untuk manipulasi hidrokarbon, sintesis protein dan vitamin. Semua aspek metabolisme jamur dimanipulasi untuk mendapatkan produk yang dapat digunakan oleh manusia.
Mikologi medis
Ini berkaitan dengan studi tentang penyakit jamur pada hewan dan manusia.
Infeksi jamur menyerang banyak orang di seluruh dunia, dan dalam beberapa kasus bisa sangat serius. Dalam bidang ini, aspek-aspek seperti perilaku patogen, siklus hidupnya, dan respons inang dipelajari.
Penelitian dilakukan tentang cara penularan dan gejala penyakit jamur. Respon imun juga dipelajari dan kemungkinan pengobatan diusulkan.
Mikologi pertanian
Mikologi pertanian berkaitan dengan studi tentang jamur yang berguna di bidang pertanian. Organisme ini merupakan bagian dari biota tanah yang penting untuk perkembangan tumbuhan.
Ada seluruh bidang penelitian di bidang pembentukan mikoriza (asosiasi akar dan jamur). Simbiosis ini sangat penting dalam pemeliharaan tanaman secara alami. Demikian juga, mereka banyak digunakan di bidang pertanian untuk mengurangi penggunaan pupuk.
Fitopatologi
Fitopatologi adalah salah satu cabang yang paling berkembang di bidang mikologi. Ini mempelajari penyakit yang disebabkan oleh jamur pada tanaman.
Persentase jamur yang tinggi merupakan parasit tanaman dan sebagian besar merupakan penyebab penyakit penting. Penyakit jamur ini menyebabkan kerugian besar di bidang pertanian.
Anggur terinfeksi Botrytis cinerea. Sumber: John Yesberg, dari Wikimedia Commons
Di bidang ini dipelajari patogen penyebab penyakit, serta gejala yang terjadi pada tanaman. Di sisi lain, rencana perawatan dan pengelolaan diusulkan untuk menghindari kerusakan besar akibat serangan jamur tersebut.
Ahli mikologi terkenal
Ahli mikologi utama yang telah memberikan kontribusi besar pada cabang ini adalah:
- Alejandro Posadas , yang pada tahun 1981 menemukan jamur bernama Coccidioides immitis.
- Pada tahun 1986, Guillermo Seeber bertemu dengan jamur yang sekarang lebih dikenal dengan nama Rhinosporidium seeberi.
- Adolpho Lutz Brasil melaporkan jamur yang dikenal sebagai Paracoccidioides brasiliensis, yang berasal dari banyak mikosis sistemik di wilayah Brasil. Ini terjadi pada tahun 1908.
- Sebaliknya, di Venezuela kemajuan ilmu mikologi semakin maju sejak tahun 1909. Berkat penemuan R. Pino Pou , maka mulai dibangun laboratorium khusus mikologi.
Contoh Penelitian Terbaru
Dalam beberapa tahun terakhir, penelitian mikologi telah difokuskan terutama pada bidang genomik dan memperoleh produk industri.
Dalam cabang studi filogenetik, genomik telah memungkinkan untuk membangun hubungan yang lebih tepat pada jamur yang membentuk mikoriza arbuskular. Kelompok ini tidak dapat tumbuh di media kultur, sehingga tidak mudah untuk mendapatkan sampel DNA.
Selama tahun 2013, dimungkinkan untuk mengurutkan genom spesies Rhizophagus irregularis (Glomeromycotina). Dengan data tersebut maka pada tahun 2016 dapat diketahui hubungan kekerabatan spesies ini dengan jamur lain.
Potensi berbagai jamur dalam produksi biofuel saat ini sedang dipelajari. Pada tahun 2017, jamur anaerobik dari genus Pecoramyces digunakan untuk mengolah residu jagung dan menghasilkan gula dan biofuel.
Para peneliti berhasil memanipulasi perilaku jamur dengan membuat variasi pada media kultur. Dengan ini, mereka mencapai produksi etanol yang tinggi melalui proses fermentasi jamur.
Referensi
- Gow N dan MG Netea (2016) Mikologi medis dan imunologi jamur: perspektif penelitian baru menangani tantangan kesehatan dunia yang utama. Phil. Trans. R. Soc.371: 1-10.
- Grigoriev I, Cullen D, SB Goodwin, DHibbett, TW. Jeffries, CP. Kubicek, C Kuske, JK Magnuson, F Martin, JW Spatafora, A Tsang dan SE Baker (2011) Mendorong masa depan dengan genomik jamur. Mikologi 2: 192-209
- Herrera, T (1994) Perspektif penelitian dalam mikologi. Bol. Soc. Bot. Meksiko 55: 39-44.
- Siniscalco C, F Doveri, G Bellato, L Campana, F Floccia, C Jacomini, C Luperi, C Marciasini dan G Visentin (2013) Sejarah mikologi italiam dan kontribusi pertama untuk nomenklatur jamur yang benar. ISPRA (Institute for Environmental Protection and Research) Roma, Italia. 101 hal.
- Zhang N, J Luo dan D Bhattacharya (2017) Kemajuan dalam filogenomik jamur dan dampaknya terhadap sistematik jamur Dalam: Townsend J dan ZWang (eds.) Fungi Filogenetik dan Filogenomik 309-328.